Virologlar, COVID’e Neden Olan Virüs Atasını ‘Neredeyse Sıfır’ Bulma Şansı Diyor



Virologlar, COVID'e Neden Olan Virüs Atasını 'Neredeyse Sıfır' Bulma Şansı Diyor

COVID-19’a neden olan virüs, muhtemelen bilim adamlarının düşündüğünden daha yakın zamanda yarasa koronavirüsleriyle bir ata paylaştı. Ancak araştırmacılar, SARS-CoV-2’nin doğrudan atasını bulmanın pek olası olmadığını söylüyor.

SARS-CoV-2 ve yakından ilişkili birkaç yarasa koronavirüsünün tam genomları, birkaç on yıl önce ortak bir ata paylaştıklarını gösteriyor. Ancak virüslerin, rekombinasyon adı verilen bir süreç olan RNA parçalarını birbirleriyle değiş tokuş ettikleri bilinmektedir, bu nedenle her bölümün kendi evrimsel geçmişi vardır. 8 Kasım’da Singapur’daki 7. Dünya Tek Sağlık Kongresi’nde sunulan son analizde bilim adamları, koronavirüs genomlarının parçalarını karşılaştırdı. Analiz, yarasa koronavirüslerinin bazı bölümlerinin ve SARS-CoV-2’nin 2016’ya kadar ortak bir ataya sahip olduğunu gösteriyor – virüs 2019’un sonlarında insanlarda ortaya çıkmadan sadece üç yıl önce. Çalışma akran tarafından gözden geçirilmedi.

Araştırmacılar, bulgunun yarasalardan kaynaklanan SARS-CoV-2’nin atası ile virüsün insanlara sıçraması arasındaki süreyi daralttığını söylüyor. Bununla birlikte, SARS-CoV-2’nin en yakın atasının bu sıçramayı nasıl yaptığını açıklamıyor – pandeminin kalıcı bir gizemi ve birçok bilim adamının muhtemelen bir aracı hayvanı içerdiğini kabul ediyor.

Doğrudan ata

Çalışma, koronavirüslerin ne sıklıkla yeniden birleştiği ve ne kadar zaman geçtiği göz önüne alındığında, yarasalarda SARS-CoV-2’nin doğrudan atasını bulmanın ne kadar zor olacağını vurguluyor. Avustralya’daki Sidney Üniversitesi’nde evrimsel bir virolog olan Edward Holmes, doğrudan bir ata bulma şansının “neredeyse sıfır” olduğunu söylüyor. “O gemi gitti.”

SARS-CoV-2’nin doğrudan atası muhtemelen birkaç virüsten oluştu ve o zamandan beri yarasalarda yeniden birleşiyor ve mutasyona uğruyor, diyor son analize katkıda bulunan San Diego California Üniversitesi’nden moleküler epidemiyolog Joel Wertheim. Koronavirüsler için örnekleme yarasaları muhtemelen şimdiye kadar bilinen koronavirüslerde bulunanlardan daha yakından ilişkili viral parçaları tanımlayabilir, ancak muhtemelen doğrudan bir ata ortaya çıkarmaz, diyor.

Pandemi başladığından beri, özellikle güneydoğu Asya’daki birçok araştırmacı, yarasalarda ve diğer memelilerde bulunan koronavirüsleri diziliyor. Ayrıca, pandemik virüsün kökenini bulma umuduyla dondurucularda saklanan eski doku örneklerinde koronavirüsleri sıraladılar. Ancak bilim adamları, pandeminin, pandeminin başladığı şehirde bulunan Wuhan Viroloji Enstitüsü’nden yanlışlıkla kaçan bir virüs tarafından tetiklendiği spekülasyonlarına yol açan SARS-CoV-2 için bir progenitör virüs bulmakta zorlandılar. Laboratuvar ilgili koronavirüsler üzerinde çalıştı.

viral parçalar

SARS-CoV-2 ile yakından ilişkili bir düzineden fazla virüs şimdiye kadar yarasalardan ve pangolinlerden izole edildi. Araştırmacılar, SARS-CoV-2 ile ilişkilerini belirlemek için genellikle yaklaşık 30.000 nükleotit uzunluğundaki tüm genomlarını karşılaştırırlar. Bu yöntemi kullanarak, SARS-CoV-2’nin bilinen en yakın akrabalarının Laos’ta bulunan BANAL-52 adlı, genomu SARS-CoV-2 ile %96,8 özdeş olan bir yarasa virüsü ve bulunan RaTG13 adlı bir virüs olduğunu buldular. Çin’in güneyindeki Yunnan’da %96,1 ile aynı. Genomları ile SARS-CoV-2’nin genomları arasındaki %3-4 fark, bu virüslerin ortak bir atayı paylaşmalarından bu yana yaklaşık 40-70 yıllık bir evrim olduğunu gösteriyor.

Ancak araştırmacılar, tüm genom dizilerini karşılaştırmanın virüs evriminde rekombinasyonun rolünü görmezden geldiğini söylüyor. Bazı RNA parçaları, SARS-CoV-2’den çok farklı olabilir, bu da onların daha uzaktan ilişkili olduklarını düşündürürken, çok daha benzer olan diğer parçalar daha yakın bir ilişki anlamına gelir.

Araştırmacılar, rekombinasyonu hesaba katmak için SARS-CoV-2 ile yakından ilişkili 18 yarasa ve pangolin virüsünü karşılaştırdı ve bunları 27 segmente ayırdı. Çalışmayı Singapur’da sunan ve İngiltere’deki Glasgow Üniversitesi’nden evrimsel bir virolog olan Spyros Lytras, her bölümün -birkaç yüz ila birkaç bin nükleotid dizisi uzunluğunda- farklı bir evrimsel tarihe sahip olduğunu söylüyor. Her bir segment için araştırmacılar, SARS-CoV-2’nin bir yarasa veya hayvan virüsü ile ne kadar yakın bir zamanda ortak bir ata paylaştığını tahmin etmek için 167 ilgili virüsün daha büyük bir alt kümesini kullandılar. Çalışma, bir gönderide anlatıldı. virological.org tartışma forumu geçen ay ve ortak yazarlar gelecek yılın başlarında bir dergiye göndermeyi planlıyorlar.

Yıllar değil, yıllar

Analiz, bazı segmentlerin sadece birkaç yıl önce SARS-CoV-2 ile ortak bir atayı paylaştığını ortaya çıkardı. Parçaların çoğu 2007 civarında ortak bir atayı paylaştı, ancak 250 nükleotit uzunluğundaki küçük bir yığın, 2016’da ortak bir ata paylaşabilirdi ve 2015’te 550 nükleotit uzunluğundaki başka bir parça, SARS-CoV’den sadece 3-4 yıl önceydi. -2 insanlarda ortaya çıktı. En genç parçalar Yunnan ve Laos’ta örneklenen yarasalardan alındı. Lytras, bu virüslerin yarasa konaklarıyla hareket edebildikleri mesafeler göz önüne alındığında, analiz, güney Çin ve güneydoğu Asya’nın SARS-CoV-2’nin ataları için sıcak noktalar olduğunu gösteriyor.

Holmes, “Bu akıllıca bir yaklaşım” diyor. “Size evrimsel zamanın en saf sinyalini verir.” Bununla birlikte, bazı parçaların oldukça kısa olduğuna dikkat çekiyor, bu da bu tahminleri daha az güvenilir hale getiriyor çünkü karşılaştırılacak sadece sınırlı sayıda RNA nükleotidi var.

Bu makale izin alınarak çoğaltılmıştır ve ilk yayınlanan 10 Kasım 2022’de.



Kaynak : https://www.scientificamerican.com/article/chances-of-finding-covid-causing-virus-ancestor-almost-nil-virologists-say/

Yorum yapın

SMM Panel PDF Kitap indir