Soğuk algınlığı ve grip virüsleri için genetik izleme şeması, tehlikeli salgınlar konusunda uyarıda bulunabilir


Grip ve RSV gibi ciddi solunum yolu enfeksiyonlarına neden olan virüslerin genlerini rutin olarak sıralamaya yönelik yeni bir çaba, daha iyi tedavilere ve aşılara yol açabilir.

Sağlık


10 Ocak 2023

SARS-CoV-2 koronavirüs parçacıklarının elektron mikroskobu görüntüsü

SARS-CoV-2 koronavirüs parçacıklarının elektron mikroskobu görüntüsü

NIAID-RML/ULUSAL SAĞLIK/BİLİM ENSTİTÜLERİ FOTOĞRAF KÜTÜPHANESİ

Birleşik Krallık’ta grip ve RSV gibi ciddi solunum yolu enfeksiyonları olan kişilerden alınan virüs örnekleri, daha iyi tedaviler ve aşıların yanı sıra tehlikeli yeni salgınlara karşı daha erken uyarıya yol açabilecek bir projede DNA dizilimi ile rutin olarak test edilecek. Teknoloji, önümüzdeki yıl daha yaygın bir şekilde kullanıma sunulmadan önce, bu yılın sonlarından itibaren covid-19 testlerinde saklanan burun sürüntüleri üzerinde denenecek.

Solunum Virüsü ve Mikrobiyom Girişimi adlı projenin arkasındaki ekip, dünyanın başka bir yerinde benzer bir plandan haberdar olmadıklarını, ancak diğer ülkelerin de aynı yaklaşımı benimsemelerini umduklarını söylüyor. Bunu teşvik etmek için, tüm yöntemleri ve verileri ücretsiz olarak kullanıma sunacaktır.

“Küresel olarak kullanılabileceğini umuyoruz” diyor Ewan Harrison projeye liderlik eden Cambridge, İngiltere’deki Wellcome Sanger Enstitüsü’nde.

Viral genomları on yıllardır dizilemek mümkün olsa da, birçok ülkenin binlerce numuneyi rutin olarak sıralamaya başlaması ancak covid-19 salgını sırasında oldu ve bu da hastalığın arkasındaki virüs olan SARS-CoV-2’nin nasıl daha hızlı geliştiğini ortaya çıkardı. beklenenden daha Diğer şeylerin yanı sıra, bu genomik gözetim, araştırmacıların ilk omikron varyantlarını tespit etmelerini ve dünya çapında büyük bir vaka dalgasına neden olacaklarını doğru bir şekilde tahmin etmelerini sağladı.

Harrison, “İnsanlık tarihinde ilk kez, büyük ölçekli genomik, hükümetlere ve politika yapıcılara bir salgında ne olacağına dair önceden uyarı sağladı ve bence bu gerçekten önemli ve derin bir değişiklik” diyor. “Bu, daha fazla geliştirmenin gerçekten önemli olduğunu düşündüğümüz bir şey.”

RSV gibi diğer birçok virüs de ciddi solunum yolu enfeksiyonlarına neden olabilir, ancak bunlara ilişkin anlayışımız son derece sınırlıdır. Harrison, “Grip vakalarında yapılan az miktarda genom dizilimi dışında, bu diğer virüslerin gerçekten rutin bir genomik gözetimi yok” diyor.

Şu anda, ciddi enfeksiyonlara neden olan virüsleri tanımlamak için yaygın olarak kullanılan testler, rinovirüs veya adenovirüs gibi yalnızca ne tür olduklarını ortaya koyuyor. Judith BreuerUniversity College London’da bir virolog.

Bir virüsün tüm genomunu sıralamak, birçok yönden yararlı olabilecek çok daha fazla bilgiyi ortaya çıkarır. Yeni başlayanlar için, insanların en etkili tedavileri almasını sağlamaya yardımcı olabilir. Covid-19 için bazı antikor tedavileri daha yeni değişkenlere karşı daha az etkili olabilirörneğin, doktorlar birisinin bu değişkenlerden birine sahip olduğunu bilirlerse hemen alternatif tedaviler uygulayabilir.

Ayrıca daha iyi aşılara yol açabilir. SARS-CoV-2 dizilimi, omikron varyantlarının dünya çapında yayıldığını ve baskın hale geldiğini ortaya çıkardığından, aşıları onlara karşı daha etkili hale getirmek için mRNA destek aşıları bu varyantlardan ikisini içerecek şekilde güncellendi.

Genetik sıralama, virüslerin nasıl yayıldığını da ortaya çıkarabilir ve bu nedenle onları kontrol altına almaya yardımcı olabilir. Örneğin, yalnızca yoğun bakımdaki iki kişinin rinovirüs enfeksiyonu olduğunu biliyorsanız, bu kişilerin hastanede mi yoksa toplum içinde mi enfekte oldukları hakkında hiçbir fikriniz olmaz, diyor Breuer. Sıralama, bize tam olarak aynı virüse sahip olup olmadıklarını ve dolayısıyla hastane enfeksiyon kontrol önlemlerinin iyileştirilmesi gerekip gerekmediğini söyleyebilir.

Son olarak, Harrison ortaya çıkan yeni hastalıkları erkenden tespit etmeyi umuyor. Diğer ülkeler de rutin genomik sürveyans yaparsa, bunu yapma olasılığı çok daha yüksek olacaktır.

Bir numunede bulunabilecek bir düzine kadar farklı virüs türünden herhangi birini sıralamak, teknik olarak sadece bir tanesini sıralamaktan daha zordur, özellikle amaç bunu dünyanın herhangi bir yerinde kullanılabilecek ucuz bir test kullanarak yapmaksa. Bu nedenle Harrison ve ekibi, Birleşik Krallık Sağlık Güvenliği Teşkilatı ile işbirliği içinde kritik hastalardan alınan taze swabları test etmeye başlamadan önce depolanmış swabları kullanarak yaklaşımlarını mükemmelleştirecek. Uzun vadede umut, sürveyansın kritik derecede hasta olanların ötesine ve diğer virüs türlerine genişletilmesidir.

Şimdilik araştırmacılar, birkaç sürüntü örneğinde bulunan tüm genetik materyali sıralamayı da planlıyorlar. Metagenomik olarak bilinen bu yaklaşım, mevcut her türlü virüs, bakteri ve mantarı tanımlamalarını sağlayarak solunum yollarının mikrobiyomunu incelemelerine olanak tanıyacak.

Breuer, “Ewan ve Sanger’ın geliştirmekte olduğu yöntemler ve teknolojiler son derece faydalı olacak” diyor. “Bu inanılmaz derecede önemli bir girişim.”

Her cumartesi size güvenebileceğiniz sağlık, diyet ve fitness haberlerini veren ücretsiz Health Check bültenimize kaydolun

Bu konularda daha fazlası:



Kaynak : https://www.newscientist.com/article/2354051-genetic-tracking-scheme-for-viruses-could-warn-of-dangerous-outbreaks/?utm_campaign=RSS%7CNSNS&utm_source=NSNS&utm_medium=RSS&utm_content=home

Yorum yapın

SMM Panel PDF Kitap indir